Одна из главных причин сокращения популяции — браконьерство, не только целенаправленное, но и случайное, с помощью проволочных петель, поставленных на кабаргу и других животных. Виду угрожает также снижение численности копытных, составляющих его кормовую базу. Хищников, вынужденных из-за этого нападать на домашний скот, отстреливает местное население.
Ещё одна проблема — уменьшение ареала обитания снежного барса в результате развития инфраструктуры и климатических изменений. Низкая численность и плотность популяционных группировок, скрытый образ жизни, труднодоступность мест обитания снежного барса до сих пор не позволяют изучить экологию вида, в том числе и такого аспекта, как размножение.